Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms