Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms