Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms