Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM15P57071 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms