Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms