Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms