Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms