Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXNP49023 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXNP49023 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXNP49023 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXNP49023 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXNP49023 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXNP49023 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXNP49023 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXNP49023 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXNP49023 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms