Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA8P48165 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms