Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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