Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER3P43115 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms