Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FLT4P35916 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FLT4P35916 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FLT4P35916 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FLT4P35916 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms