Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms