Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPS1P31327 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPS1P31327 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPS1P31327 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms