Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms