Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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