Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHCGRP22888 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms