Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARBP10826 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARBP10826 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RARBP10826 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RARBP10826 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RARBP10826 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms