Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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