Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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