Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNOT11Q9UKZ1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNOT11Q9UKZ1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms