Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC4Q9UBN4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms