Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC180Q9P1Z9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC180Q9P1Z9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms