Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms