Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPV4Q9HBA0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms