Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM15Q9C019 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.8 ms