Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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