Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BICD1Q96G01 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BICD1Q96G01 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms