Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms