Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATL1Q8WXF7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATL1Q8WXF7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms