Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms