Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms