Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCBE1Q6UXH8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCBE1Q6UXH8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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