Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms