Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms