Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms