Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms