Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms