Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms