Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ECM1Q16610 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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