Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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VPS72Q15906 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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VPS72Q15906 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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VPS72Q15906 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS72Q15906 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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