Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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