Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUM3Q15397 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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