Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms