Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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NFIXQ14938 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NFIXQ14938 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NFIXQ14938 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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