Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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NCOA4Q13772 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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NCOA4Q13772 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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NCOA4Q13772 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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