Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
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