Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN3Q13286 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CLN3Q13286 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CLN3Q13286 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CLN3Q13286 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CLN3Q13286 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN3Q13286 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CLN3Q13286 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CLN3Q13286 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CLN3Q13286 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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CLN3Q13286 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CLN3Q13286 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN3Q13286 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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