Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CSTF3Q12996 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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