Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms